Aはい、その場合でもマナゾーンからクリーチャーを出します。
「その後」以降に書かれた効果は、その前に書かれた効果を行えなかった場合でも解決します。
そのため、自分のクリーチャーが１体もいない状況や、《支配の精霊ペルフェクト / ギャラクシー・チャージャー》のようなマナゾーンに置かれないクリーチャーしかいない状況で《天翔と紋章の門》を唱えた場合も、自分のマナゾーンにあるカードの枚数以下のコストのエンジェル・コマンド・クリーチャーを自分のマナゾーンから出します。